昆明植物所更新蘑菇目分類(lèi)系統(tǒng)
眾多耳熟能詳?shù)氖秤镁?、藥用菌和毒蘑菇,都是蘑菇目(Agaricales)的成員,該目真菌具有重要經(jīng)濟(jì)價(jià)值和生態(tài)價(jià)值。前人將該目真菌劃分為8亞目、46科,然而一些科屬的系統(tǒng)位置以及科屬內(nèi)的親緣關(guān)系并不清楚。例如,擬口蘑屬(Tricholomopsis)和元蘑屬(Sarcomyxa)真菌的系統(tǒng)位置就一直沒(méi)有定論。
與國(guó)內(nèi)外同行合作,中國(guó)科學(xué)院昆明植物研究所真菌多樣性與分子進(jìn)化專(zhuān)題組對(duì)全球擬口蘑屬、元蘑屬、大核瑚菌屬(Macrotyphula)、黃側(cè)耳屬(Phyllotopsis)等類(lèi)群的真菌樣品開(kāi)展了淺層基因組測(cè)序,結(jié)合數(shù)據(jù)庫(kù)中公開(kāi)的蘑菇目其他某些物種的基因組數(shù)據(jù),通過(guò)單拷貝直系同源基因提取、基因沖突檢測(cè)、系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)構(gòu)建、拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)檢測(cè)等分析方法,基于555個(gè)單拷貝直系同源基因的氨基酸序列,重建了迄今解析度和分辨率最高的蘑菇目系統(tǒng)發(fā)育框架,明晰了多數(shù)亞目間的親緣關(guān)系,錨定了擬口蘑屬和元蘑屬的系統(tǒng)位置。該研究提出蘑菇目10亞目的新分類(lèi)系統(tǒng),對(duì)其中數(shù)個(gè)亞目的成員做了適當(dāng)調(diào)整,正式發(fā)表2個(gè)新亞目(元蘑亞目Sarcomyxineae和黃褶菌亞目Phyllotopsidineae)、1個(gè)新屬(錐頭傘屬Conoloma)、2個(gè)新組和6個(gè)新種,解決了我國(guó)擬口蘑屬分類(lèi)中的諸多問(wèn)題,探討了該屬物種的基質(zhì)偏好性和菌蓋表面鱗片演化規(guī)律。
該研究對(duì)進(jìn)一步認(rèn)識(shí)蘑菇目各大類(lèi)群間的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系具有較重要的科學(xué)意義,成果發(fā)表在中國(guó)菌物學(xué)會(huì)的旗艦期刊Mycology上。昆明植物研究所博士研究生王庚申為論文第一作者,楊祝良研究員為通訊作者。該研究得到了云南省科技領(lǐng)軍人才項(xiàng)目(202305AB350004)等項(xiàng)目的資助。
圖1. 基于555個(gè)單拷貝直系同源基因構(gòu)建的蘑菇目最大似然樹(shù)。節(jié)點(diǎn)數(shù)值為BS支持率,未標(biāo)注數(shù)據(jù)的節(jié)點(diǎn)支持率為100%。
圖2. 擬口蘑屬Tricholomopsis部分物種的野外照片。a–b 草甸擬口蘑T. compestris;c 凹蓋擬口蘑T. depressa;d 火紅擬口蘑T. flammula;e 淡粉擬口蘑T. mitirubicunda;f 淡黃擬口蘑T. pallidolutea;g 赭紅擬口蘑T. rutilans;h 硫色擬口蘑T. sulfureoides;i 云南擬口蘑T. yunnanensis。比例尺=1 cm。
圖3. 擬口蘑屬基質(zhì)偏好和蓋表鱗片祖先狀態(tài)重建。擬口蘑屬下各組名稱(chēng)標(biāo)注在對(duì)應(yīng)的分支。
來(lái)源:中國(guó)科學(xué)院昆明植物研究所 作者:王庚申,楊祝良