【科研進(jìn)展】育種團(tuán)隊(duì)在香菇多階段形態(tài)建成和雙親角色變化的核轉(zhuǎn)錄組學(xué)上取得新進(jìn)展
近期,上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所良種創(chuàng)新與繁育團(tuán)隊(duì)以六個(gè)擁有不同細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)基因型的單單雜交后代為材料,從多個(gè)培養(yǎng)階段的形態(tài)特征和細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)入手,探究了香菇多階段的形態(tài)建成規(guī)律、香菇栽培菌株細(xì)胞核基因型不易替換的原因和雙親角色變化(父本或母本遺傳物質(zhì)改變)對(duì)后代細(xì)胞核基因表達(dá)的影響。相關(guān)研究成果發(fā)表在國(guó)際學(xué)術(shù)期刊Applied Microbiology and Biotechnology(IF:5.0)上。
圖1 六個(gè)單單雜交后代多階段形態(tài)特征及與雙親角色變化顯著調(diào)控的特異性差異表達(dá)基因篩選
香菇單單雜交后代在不同培養(yǎng)階段的形態(tài)特征和細(xì)胞核基因表達(dá)主要受雙親細(xì)胞核遺傳物質(zhì)調(diào)控,其次是細(xì)胞質(zhì)。野生細(xì)胞核基因型的導(dǎo)入易導(dǎo)致后代不出菇或出菇性狀不穩(wěn)定,而野生細(xì)胞質(zhì)基因型的替換可作為香菇栽培菌株改良的一種方式。在營(yíng)養(yǎng)階段,雙親角色變化會(huì)顯著調(diào)控某些特異性基因的差異表達(dá),從而讓后代呈現(xiàn)出不同的代謝、生長(zhǎng)規(guī)律和形態(tài)特征。
圖2 香菇不同代料栽培階段的轉(zhuǎn)錄組變化及菌絲頂端細(xì)胞極性生長(zhǎng)、胞外酶外排和營(yíng)養(yǎng)吸收的過(guò)程
在液體搖瓶和代料基質(zhì)培養(yǎng)后期,香菇菌絲體呈現(xiàn)出不同的碳代謝途徑,特別在次級(jí)代謝、木質(zhì)纖維素降解和跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)方面。其中,香菇菌絲體在代料基質(zhì)培養(yǎng)過(guò)程中,養(yǎng)菌階段主要進(jìn)行初級(jí)代謝以擴(kuò)大生物量,轉(zhuǎn)色階段主要進(jìn)行次級(jí)代謝為后期子實(shí)體形成做準(zhǔn)備。菌蓋從結(jié)構(gòu)初建至剛開傘階段,主要進(jìn)行營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)和水分的跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)用于細(xì)胞擴(kuò)增,而從剛開傘至近平展階段,主要開展與核糖體蛋白和細(xì)胞色素P450相關(guān)的蛋白合成和代謝過(guò)程。
宋曉霞副研究員為論文第一作者,陳明杰研究員為共同第一作者,宋春艷研究員為通訊作者。該研究工作得到了國(guó)家食用菌產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系項(xiàng)目的資助。宋曉霞從2013年入職食用菌所至今,一直致力于將我國(guó)豐富的野生香菇種質(zhì)資源用于栽培菌株改良研究:首先從細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)基因組分型角度對(duì)中國(guó)香菇種質(zhì)資源的分類進(jìn)行梳理,明確我國(guó)不同栽培技術(shù)發(fā)展階段栽培菌株的細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)基因組類型發(fā)生更替,并首創(chuàng)了一種適于中國(guó)香菇代料栽培階段栽培菌株改良的新技術(shù)-香菇種內(nèi)不同基因型間的異源細(xì)胞質(zhì)育種技術(shù)。
來(lái)源:漫步菇道