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演化時(shí)間可成為劃分真菌分類等級(jí)新標(biāo)準(zhǔn)

發(fā)布時(shí)間:2018-01-02

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日前,中國(guó)科學(xué)院微生物研究所趙瑞琳課題組首次把真菌的演化時(shí)間應(yīng)用于確定分類等級(jí)和分類系統(tǒng)重建工作中,制定了演化時(shí)間作為確定分類等級(jí)的一個(gè)新標(biāo)準(zhǔn)。她說(shuō):“在劃分單系類群的分類等級(jí)時(shí),相同分類等級(jí)的演化時(shí)間應(yīng)大體一致;高分類等級(jí)的演化時(shí)間要早于低分類等級(jí)的原則。”相關(guān)論文已發(fā)表于真菌學(xué)領(lǐng)域的權(quán)威期刊。

趙瑞琳介紹了該研究思路首先在種類及進(jìn)化支序繁多的蘑菇屬上應(yīng)用,具體工作為:在700余世界各地樣品初步的系統(tǒng)發(fā)育分析的基礎(chǔ)上,以兩個(gè)傘菌綱化石標(biāo)本為演化時(shí)間校訂點(diǎn),通過(guò)多基因序列的分子鐘分析,確定蘑菇屬演化形成于6600萬(wàn)年前;在3000萬(wàn)年前形成6個(gè)單系支序(被命名為亞屬);在2000萬(wàn)年前左右,進(jìn)一步分化出的22個(gè)單系支序(被命名為組);而其他單系支序由于形成時(shí)間明顯晚于上述時(shí)間,不被劃分為任何一個(gè)種上分類單元,最終重建了蘑菇屬的世界性分類體系,解決了蘑菇屬內(nèi)大量新進(jìn)化分支的命名分類難點(diǎn)。

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趙瑞琳說(shuō):“我們首先集結(jié)近十年來(lái)?yè)?dān)子菌門(mén)的最新進(jìn)展,分別構(gòu)建了擔(dān)子菌門(mén)6個(gè)基因的系統(tǒng)發(fā)育圖譜,及基于396個(gè)直系同源基因的系統(tǒng)發(fā)育圖譜?!?/font>

隨后的分子鐘分析表明擔(dān)子菌門(mén)演化形成于5.3億年前,擔(dān)子菌門(mén)中4個(gè)亞門(mén)的演化時(shí)間為4億~4.9億年前,對(duì)于具有大型子實(shí)體的傘菌綱的演化時(shí)間范圍分別為3.4億~3.9億年前,具有較小子實(shí)體的銹菌亞門(mén)和黑粉菌亞門(mén)中綱的演化時(shí)間范圍分別為2.4億~3.4億年前;擔(dān)子菌門(mén)中各個(gè)目的演化時(shí)間為1.2億~2.9億年前。

因此,趙瑞琳建議把這些演化時(shí)間作為建立擔(dān)子菌門(mén)中目及目以上分類等級(jí)的一個(gè)依據(jù)。借助于演化時(shí)間這一新標(biāo)準(zhǔn),還新認(rèn)定一個(gè)亞門(mén)Wallemiomycotina;發(fā)現(xiàn)1個(gè)目由于過(guò)于年輕的演化時(shí)間建議廢除;2個(gè)科由于具有的古老演化時(shí)間,分別正式提升為2個(gè)目。

趙瑞琳課題組的研究表明,演化時(shí)間可以成為劃分真菌分類等級(jí)的一個(gè)新標(biāo)準(zhǔn),而且給出了擔(dān)子菌門(mén)劃分亞門(mén)、綱、亞綱和目的演化時(shí)間范圍標(biāo)準(zhǔn)。此研究方法為解決大量發(fā)現(xiàn)的新進(jìn)化支序的合理分類問(wèn)題,制定更客觀和穩(wěn)定的分類系統(tǒng)提供新的依據(jù),目前已在其他類群(如子囊菌門(mén),表生真菌等)的系統(tǒng)學(xué)研究中采用。

來(lái)源||中國(guó)科學(xué)報(bào)

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